Trong khi Đảng Sâm Bắc sinh tổng hợp để tích lũy các alkaloid như codonopyrrolidium, thì Đảng Sâm Nam lại hướng con đường chuyển hóa sang việc xây dựng một hệ thống Saponin và Terpenoid Glycoside vô cùng phong phú. Đây chính là điểm khác biệt lớn nhất làm nên bản sắc và định hình phổ tác dụng dược lý của dược liệu.

Đặc trưng cấu trúc: Saponin trong Đảng Sâm Nam chủ yếu là các saponin triterpenoid. Chúng tồn tại dưới dạng cấu trúc lưỡng tính, bao gồm một bộ khung lõi kỵ nước aglycone/sapogenin chứa 30 nguyên tử carbon liên kết với các gốc đường ưa nước Hai cấu trúc cốt lõi thường gặp nhất là khung oleanan pentacyclic và dammaran tetracyclic. Do mang cấu trúc lõi điển hình của nhóm oleanan, acid oleanolic thường được sử dụng làm chất chuẩn để định lượng hàm lượng saponin tổng số.

Tính chất hóa học đặc trưng: Các saponin trong rễ củ có khả năng tạo bọt bền trong nước. Khi kết hợp với vanillin và các acid vô cơ mạnh như acid perchloric, acid acetic rồi đun nóng, genin của saponin tách nước tạo thành nhóm methylene chưa no, cho ra phức hợp màu tím hoa cà đặc trưng hấp thụ cực đại ở bước sóng 548 – 550 nm.

Hàm lượng Saponin tập trung chủ yếu ở phần rễ củ. Trong rễ Đảng Sâm Nam sống, hàm lượng saponin đạt khoảng 2,17% và duy trì ở mức 1,47% sau quá trình chưng cất, chế biến. Đáng chú ý, kết quả khảo sát thực tế trên rễ Đảng Sâm Nam 3 năm tuổi trồng tại Lâm Đồng cho thấy hàm lượng saponin toàn phần đạt trung bình tới 8,93% vượt xa tiêu chuẩn đề xuất là ≥ 3,0%. 

Độ an toàn cao: Nhờ bản chất là các glycoside chứa đường, saponin của Đảng Sâm Nam tan tốt trong nước nóng và dung môi phân cực, giúp giải phóng hiệu quả qua các phương pháp đun sắc hoặc ngâm rượu. Điểm ưu việt là các saponin này không có tính phá huyết mạnh hay độc tính tích lũy, đảm bảo an toàn cao khi sử dụng dài ngày.